En 2018, la Fundación Carolina firmó nuevos convenios de cooperación educativa con la Universidad Católica de Colombia, la Universidad Católica de Manizales, la Universidad Central y la Universidad de Caldas, los cuales regulan la participación de estas universidades en los programas de doctorado y estancias cortas postdoctorales gestionadas por el programa de formación de la Fundación, sumándose a las cerca de 30 universidades colombianas que ya cuentan con este modelo de cooperación.
Las becas de doctorado están dirigidas a fomentar la obtención del grado académico de doctor entre los docentes de las universidades de América latina asociadas con la FC, mientras que el objetivo de las becas de Estancias cortas postdoctorales es completar la formación postdoctoral de los profesores de estos centros y facilitar el establecimiento de redes académicas entre España y América Latina. Ambos tipos de becas se basan en un régimen de cofinanciación, fijado en convenios bilaterales de cooperación educativa, inspirado fundamentalmente en el principio de igualdad de oportunidades.
La ventaja más apreciable que aporta este programa es que hace copartícipes de estas becas a las universidades latinoamericanas para que estos docentes, una vez alcanzan el grado de doctor, retornen a sus universidades de origen que, en definitiva, son las corresponsables económicas de su formación.